Abre la imagen que deseas recortar para el web, abre las reglas (Control+R) y asegurate de que la opción Snap to Guides este chequeada en (View> Snap To Guides) . 
Para crear una linea guia presiona sobre la regla y sosten el boton del mouse y muevelo al lugar donde deseas tu linea guia y suelta el boton del mouse.

Crea las lineas guias para que despues no varie el tamaño selecciona y marca el area que deseas recortar. 
Ahora copia (Edit> Copy) el area y pegala en un documento nuevo (File> New - Edit> Copy) , Si estas trabajando con varios layers en lugar de hacer el simple copy deberas usar (Edit> Copy Merged) y pegala en un documento nuevo (File> New - Edit> Copy)